La fondation a été créée par 14 membres fondateurs :
1 siège pour le CNRS
1 siège pour l’INSERM
1 siége pour l’Université de la Méditerranée
1 siège pour l’Université de Montpellier 1
1 siège pour l’Université de Montpellier 2
1 siège pour l’Université de Nice Sophia Antipolis
1 siège pour l’Assistance Publique, Hôpitaux de Marseille
1 siège pour le CHU de Montpellier
1 siège pour le CHU de Nice
1 siège pour le Service de Santé des Armées.
1 siège pour IRD
1 siège pour l’Etablissement Français du Sang
1 siège pour BioMérieux
1 siège pour Elitech
Depuis sa création, la fondation Infectiopôle Sud a été rejoint par plusieurs membres partenaires dont :
Sanofis Aventis
IMTSSA
CHU de Nîmes